Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl8Q9Z121 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms