Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms