Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms