Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slfn1Q9Z0I7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn1Q9Z0I7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms