Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms