Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Nfe2l3Q9WTM4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Nfe2l3Q9WTM4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Nfe2l3Q9WTM4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms