Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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