Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms