Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms