Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd164Q9R0L9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms