Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pcm1Q9R0L6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pcm1Q9R0L6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pcm1Q9R0L6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pcm1Q9R0L6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pcm1Q9R0L6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pcm1Q9R0L6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pcm1Q9R0L6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pcm1Q9R0L6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcm1Q9R0L6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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