Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms