Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms