Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Exo1Q9QZ11 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Exo1Q9QZ11 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms