Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rdh11Q9QYF1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rdh11Q9QYF1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rdh11Q9QYF1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rdh11Q9QYF1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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