Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Foxe3Q9QY14 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms