Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms