Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim44Q9QXA7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim44Q9QXA7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim44Q9QXA7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim44Q9QXA7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim44Q9QXA7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim44Q9QXA7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim44Q9QXA7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim44Q9QXA7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim44Q9QXA7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms