Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms