Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms