Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mid2Q9QUS6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms