Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms