Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms