Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rabgef1Q9JM13 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rabgef1Q9JM13 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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