Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms