Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tgm1Q9JLF6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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Tgm1Q9JLF6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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Tgm1Q9JLF6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Tgm1Q9JLF6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms