Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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CubnQ9JLB4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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