Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gde1Q9JL56 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms