Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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