Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Tmod2Q9JKK7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmod2Q9JKK7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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