Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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