Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc86Q9JJ89 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccdc86Q9JJ89 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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