Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cml1Q9JIZ0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms