Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms