Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms