Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tm9sf3Q9ET30 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tm9sf3Q9ET30 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tm9sf3Q9ET30 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tm9sf3Q9ET30 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tm9sf3Q9ET30 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tm9sf3Q9ET30 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tm9sf3Q9ET30 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tm9sf3Q9ET30 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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