Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms