Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp29Q9ES63 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms