Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cse1lQ9ERK4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cse1lQ9ERK4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms