Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms