Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Barx1Q9ER42 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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