Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ropn1lQ9EQ00 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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