Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms