Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a1Q9EPE9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms