Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Xab2Q9DCD2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms