Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmg20aQ9DC33 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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