Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Csnk1dQ9DC28 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Csnk1dQ9DC28 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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