Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf6Q9DBU5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms