Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms