Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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